Viện Kỹ thuật quân sự được thành lập theo Quyết định của Hội đồng khoa học MPEI với mục đích tăng chất lượng đào tạo quân sự cho sinh viên tại Trung tâm huấn luyện quân sự trực thuộc trường Đại học, nâng cao trình độ chuyên môn của cán bộ khoa học và giảng viên của Viện và tăng cường tương tác về giáo dục và phương pháp đào tạo với các trường đại học trực thuộc Bộ Quốc phòng Nga nói riêng và Bộ Quốc phòng Nga nói chung. Tại Viện, việc tổ chức tuyển chọn sinh viên tốt nghiệp để cử học tiếp tại các cơ quan của Bộ Quốc phòng Liên bang Nga được đặc biệt chú trọng. Cơ cấu tổ chức của Viện bao gồm: Trung tâm thiết kế và kỹ thuật MPEI, Trung tâm phát triển Sambo mang tên A.A. Kharlampiev ", TPK "Chân trời", Trung tâm giáo dục quốc phòng trực MPEI và trường bắn thực hành MPEI - "Hồ Gấu".